ศูนย์วิทยาศาสตร์ได้รับการตรวจสอบสภาพอาคารเฉลิมพระเกียรติ 50 พรรษา มหาวชิราลงกรณ ประจำปี 2564 ในวันที่ 10 กุมภาพันธ์ 2564 จากกรมโยธาธิการและผังเมือง พระรามหก โดยอาคารเฉลิมพระเกียรติ 50 พรรษา มหาวชิราลงกรณ จัดเป็นอาคารขนาดใหญ่พิเศษ จึงใช้ข้อกำหนดตามกฎกระทรวงว่าด้วยการควบคุมอาคารฉบับที่ 33 (พ.ศ. 2535), ฉบับที่ 50 (พ.ศ.2540) ,ฉบับที่ 55 (พ.ศ.2543) และข้อเสนอแนะของกฎกระทรวงการแก้ไขอาคารที่เพิ่มเติม บังคับใช้วันที่ 3 ธันวาคม 2563 ในการตรวจสอบอาคาร โดยมีบุคลากรสำนักงานบริการอาคารวิทยาศาสตร์ บุคลากรกองอาคารและสถานที่ เข้าร่วมการตรวจสอบสภาพอาคารและรับฟังข้อเสนอแนะที่ต้องดำเนินการปรับปรุง